连长是基层军事主官，我国开国将帅绝大多数都有当连长的经历。比如，开国大将许光达当过第11军25师75团3营11连代理连长、开国上将李天佑当过特务连连长、开国中将秦基伟当过总部手枪营连长。
指导员全称是政治指导员，工作性质与教导员（营一级）、政委（团级以上）如初一辙。第二炮兵原政委张海阳上将，就担任过第21军63师189团1连政治指导员。
政委军衔级别（最低上校）远比指导员高，可指导员的历史要早于政治委员制度，也是后来政委制度的预演。
指导员的历史，可以追溯到三湾改编，确立了支部建在连上的基本建军原则，这在我军各个时期发挥了重要作用。
1988年9月，我军恢复军衔制，废除了大尉军衔，连长、指导员都是正连级上尉。既然如此，连长、指导员到底谁听谁？《士兵突击》中的钢七连是一个很好的突破点。
钢七连在临近解散之际，高城、洪兴国二人情绪都很低落，一时难以接受部队被整编。高城难掩伤心之情，对着洪兴国说道：“我挺对不住你的，老压着你”
洪兴国反问：“压着我？指导员是协助你工作的，你怎么压着我了？”高城说道：“我打球犯规，下棋使损招，打牌都给他们使眼色……”言语平常不带任何煽情字眼，却无不令人泪目。
接下来，洪兴国的回答就说明了指导员跟连长的关系。洪兴国肯定了高城是钢七连的一号，钢七连不能输，钢七连连长也不能输。洪兴国是政工干部，要时时刻刻维护军事主官的权威，这也是指导员的工作之一。
通过二人的对话，基本上捋清了连长和指导员之间的关系。连长负责军事工作，自然是当之无愧的一号人物。由于我军实行的是双首长制度，指导员就是二号人物，协助高城展开政治工作。
但我军有一个大原则，即支部建在连上。指导员是连党委的书记，连长只能是副书记。就连队党支部内部而言，指导员领导连长展开党支部的工作。
所以，连长、指导员之间不存在谁听谁的问题，二者是平级关系，在各自领域都有各自的职责。一言以蔽之，还是《亮剑》中李云龙说的那样：团长管军事，政委管生活。
