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时间:2024-07-21 21:42:24编辑:奇事君

如何构建系统发育树

无论是基于距离的系统发生树重建方法,还是基于特征的系统发生树重建方法,都不能保证一定能够得到一棵描述比对序列进化历史的真实的树。一般地,对于某个数据集,如果用一种方法能推断出正确的系统发生关系,则用其它流行的方法也能得到较好的结果。但是,如果模拟数据集中序列的变化很大,或不同的分支变化速率不同,则没有一种方法是十分可靠的。扩展资料:系统树是一种分支图(英文cladogram)。在树中,每个节点代表其各分支的近共同祖先,而节点间的线段长度对应演化距离(如估计的演化时间)。系统发生树有时也称系统树图,它是由一系列节点和分支组成的。其中每一个节点代表一个分类单元,分支末端的节点对应 一个基因或者生物体。与外部节点对应,内部节点代表一个推断出的共同祖先。系统发生树结构的基本信息在计算机程序中常常用一组嵌套的圆括号表示,成为newick格式。参考资料来源:百度百科-系统发生树

怎么运用系统发育树?

近年来叶绿体基因间序列已被广泛应用于苔藓、球兰、骨碎补科、蓼科、常绿植物、角果木等植物系统发育性及地理亲缘关系。通过本实验来学习和研究如何运用软件基于trnT-trnL序列分析同科植物的遗传关系。 通过本实验能够熟练掌握数据采集和分析等分子实验中的常用方法进一步提高自己的收集数据的能力和数据分析工具的使用能力。 关键词trnT-trnL 物种 遗传关
系统发育 系统发育phylogeny也称系统发展是与个体发育相对而言的它是指某一个类群的形成和发展过程。大类群有大类群的发展史小类群有小类群的发展史从大的方面看如果研究整个植物界的发生与发展便称之为植物界的系统发育。同样也可以研究某个门、纲、目、科、属的系统发育甚至在一个包含较多种以下单位亚种变种的种中也存在种的系统发育问题。例如在单子叶植物的菝葜科Smilacaceae中有各种类型的植物有木本的、草本的有直立的、攀缘的有单花序的、也有复合花序的等等。这些类群之间在进化上有何联系哪个类群较为原始哪个类群较为进化对这类问题的探讨就是探讨各类群的系统发育。种是分类的基本单位但在种之下又有亚种、变种、变型这说明在一个种的范围内也有变化和发展这就是种的系统发育。同样道理纲、目、科、属各个分类等级均有其系统发育。 系统发育树 系统学分类描述了不同生物之间的相关关系通过系统学分类分析可以帮助人们了解所有生物的进化历史过程。这一过程并不能够直接看到人们只能通过相关线索了解历史上曾经发生了什么而科学家就是用这些线索建立各种假说、模型甚至是生命发生的历史。在系统学分类的研究中最常用的可视化表示进化关系的方法就是绘制系统发育进化树Phylogenetic trees用一种类似树状分支的图形来概括各种类生物之间的亲缘关系。通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树称为分子系统树molecular phylogenetic tree。 进化树由结点node和进化分支branch组成每一结点表示一个分类学单元属、种群、个体等进化分支定义了分类单元祖先与后代之间的关系一个分支只能连接连个相邻的结点。进化树分支的图像称为进化的拓扑结构其中分支长度表示该分枝进化过程中变化的程度标有分枝长度的进化分支叫标度枝scaled branch。校正后的标度树scaled tree常常用年代表示这样的树通常根据某一或部分基因的理论分析而得出。进化分支可以没有分支长度的标注unscaled没有被标注的分支其长度不表示变化的程度虽然分支的有些地方用数点进行了注释。 进化树可以是有根的(rooted)也可以是无根的unrooted分为“有根树”和“无根树”两类 。在有根树中有一个叫根root的特殊结点用来表示共同的祖先由该点通过唯一途径可产生其他结点有根树是具有方向的树包含唯一的节点将其作为树中所有物种的最近共同祖先。无根树只是指明了种属的相互关系没有确认共同祖先或进化途径。最常用的确定树根的方法是使用一个或多个无可争议的同源物种作为“外群”英文outgroup这个外群要足够近以提供足够的信息但又不能太近以致不能和树中的种类相混。把有根树去掉根即成为无根树。一棵无根树在没有其他信息外群或假设如假设最大枝长为根时不能确定其树根。无根树是没有方向的其中线段的两个演化方向都有可能


几何数学题

解:过点C作CO平分角ACB与BP相交于点O,连接AO
因为BP平分角ABC
所以点O是三角形ABC的内心
所以角OAC=1/2角BAC
角OBC=1/2角ABC
角OCB=角ACO=1/2角ACB
因为角COP=角OBC+角OCB
所以角COP=1/2(角ABC+角ACB)
因为角ABC+角ACB+角BAC=180度
所以角COP=90-1/2角BAC
因为CP平分角ACD
所以角ACP=1/2角ACD
因为角ACB+角ACD=180度
所以角ACO+角ACP=角OCP=90度
因为角OCP+角BPC+角COP=180度
因为角BPC=40度
所以角COP=50度
角BAC=80度
所以角OAC=40度
所以角OAC=角BPC=40度
所以A,O,C,P四点共圆
所以角COP=角CAP
所以角CAP=50度


Base64编码是加密算法吗?

大家好,我是阿萨。昨天和开发同学一起开会的时候。开发同学说到了用Base64编码,我立即说 不能使用Base64加密。然后开发来了一句Base64不是加密算法。当时懵了。默默记下这个知识点,回来学习下。




先给大家讲解下我为什么会有不能使用Base64加密的意识。很多年前,我遇到的第一个安全问题,就是敏感数据用Base64加密了。 事情起因是,我们接到一个bug,说有个敏感字段使用Base64在前端加密了,然后传给后端了。



基于之前的小故事,对于使用了Base64编码的地方就觉得不安全。这也是为什么会对开发说不能用Base64加密了,



今天我们就来学习下Base64编码。



一,Base64编码的由来。



传说,最开始互联网电子邮件都是英文的,后来互联网传到中国后,互联网电子邮件汉字就不认识了。所以就有了Base64编码,把中文变成可识别的英文。然后Base64编码被广泛用到各行各业。



以上只是传说。真实的由来,就不得而知了。



下面我们从计算机的底层传输过程中。它分为可见字符和不可见字符。可见字符比如我们熟知的ASCII码。



还有一些不可见的控制字符(0~31以及127),比如回车,换行等以及一些二进制数据都是不可见字符。



这些不可见字符在一些硬件,比如交换机,路由器以及网关等识别或者解析错误,导致错误发生,所以就有了Base64编码的市场。因此Base64产生了。



二,Base64 编码的原理



Base64编码就是要把不可见的字符转换成常见的64个字符的过程。

这64个字符是哪些呢?










那么它工作原理是啥呢?



1) 首先把整段传输内容全部划分成三个字节一组。这里就有了24bit了.



2) 然后把24bit 分成四组。每一组就有6bit



3)在6bit的最前面添加2个0,这样就有了8bit



4)把这8bit 转换成一个字节。查找上表中对应字符。所有其他分组内容按照这样的处理逻辑处理下。就得到了Base64的编码后字符。



注意,如果不够三字节,用0填到三字节,同时补充了多少个字节的0,末尾就添加就几个=。



分别图示下以上过程:

三个A










2个A,补充一个0









1个A,补充2个0












三,总结

Base64编码不是用来加密的,也不是加密算法。它只是用来编码的。切记不可用于加密。如果敏感信息用Base64编码加密了,赶紧提bug。



经过今天的学习,希望大家有所收获。



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如何使用Base64进行加密和解密

其实Base64的加密和解密的算法不是很复杂,首先是定义自己64位的密钥,64个字符是固定,但是顺序是可以随自己的设计而变化。例如:
char[] BaseTable=new char[64]{
'A','B','C','D','E','F','G','H','I','J','K','L','M','N','O','P','Q','R','S','T','U','V','W','X','Y','Z',
'a','b','c','d','e','f','g','h','i','j','k','l','m','n','o','p','q','r','s','t','u','v','w','x','y','z',
'0','1','2','3','4','5','6','7','8','9','+','/'};

接下来,在加密的时候就是对于需要加密的每个字符,通过一定的算法,转换成上面64字符的一种;而在解密的时候则是把64字符中任意一个字符反算出加密前的字符。对于每个字符的操作有很多方法,这里就不一一介绍了。需要注意的是“=”字符,在Base64加密算法中,是很重要的,它是起到补零作用。

以下是完整代码:
//----------------------------- Base64 class --------------------------------------
//---------------------------------------------------------------------------------
//---File:clsBase64
//---Description:The class file to encode string or decode string in base algorith
//---Author:Knight
//---Date:Oct.8, 2005
//---------------------------------------------------------------------------------
//----------------------------{ Base64 class }-------------------------------------
using System;

namespace Base64
{
///
/// Summary description for clsBase64.
///
public class clsBase64
{
private char[] source;
private char[] lookupTable;
private int length, length2, length3;
private int blockCount;
private int paddingCount;

public clsBase64()
{
//
// TODO: Add constructor logic here
//
source = null;
length = length2 = length3 =0;
blockCount = 0;
paddingCount = 0;
}

///
/// Create base64 char array using default base64 char array
///
///
/// return the new base64 char array
private char[] CreateBase64Char( ref char[] CreatePara )
{
char[] BaseTable=new char[64]{
'A','B','C','D','E','F','G','H','I','J','K','L','M','N','O','P','Q','R','S','T','U','V','W','X','Y','Z',
'a','b','c','d','e','f','g','h','i','j','k','l','m','n','o','p','q','r','s','t','u','v','w','x','y','z',
'0','1','2','3','4','5','6','7','8','9','+','/'};

const int CREATE_TYPE = 8;
byte bParaValue = 0;
byte bTemp;
for( int i = 0; i < CreatePara.Length; i++ )
{
bTemp = ( byte )( CreatePara[i] );
switch( bTemp % CREATE_TYPE )
{
case 1:
// 00000001
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x01 );
break;
case 2:
// 00000010
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x02 );
break;
case 3:
// 00000100
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x04 );
break;
case 4:
// 00001000
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x08 );
break;
case 5:
// 00010000
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x10 );
break;
case 6:
// 00100000
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x20 );
break;
case 7:
// 01000000
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x40 );
break;
default:
// 10000000
bTemp =( byte )( bTemp ^ 0x80 );
break;
}
bParaValue =( byte )( bParaValue ^ bTemp );
}

char chrTemp;
int nIndex;
switch( bParaValue % CREATE_TYPE )
{
case 1:
// Exechange 0 1, 2 3, 4 5, 6 7
for( int i = 0; i < BaseTable.Length / CREATE_TYPE; i++ )
{
nIndex = i * CREATE_TYPE;
chrTemp = BaseTable[nIndex];
BaseTable[nIndex] = BaseTable[nIndex + 1];
BaseTable[nIndex + 1] = chrTemp;
chrTemp = BaseTable[nIndex + 2];
BaseTable[nIndex + 2] = BaseTable[nIndex + 3];
}
//remove paddings
length3=length2-paddingCount;
byte[] result=new byte[length3];

for(int x=0;x {
result[x]=buffer2[x];
}

return result;
}

private byte char2sixbit(char c)
{
if( c=='=' )
return 0;
else
{
for (int x=0;x<64;x++)
{
if (lookupTable[x]==c)
return (byte)x;
}
//should not reach here
return 0;
}
}

}
}


3000元组装台式电脑(无显示屏)

CPU I3 2100(盒)780
主板:精英H61H2-M3 599
内存:宇瞻2G DDR3 1333经典系列 100
硬盘:西数5000AAKX 16MB 蓝盘 260
显卡:INNO3D GTS450游戏至尊 698
机箱:游戏悍将(Game Demon)电脑机箱 独狼1标准版-蓝光 139
电源:超频三(PCCOOLER)X5炫彩版 额定350W 120mm风扇 209

CPU用是是第二代的I系列处理器,I3 2100

主板是稳定型的精英H61H2-M3 ,显卡是一线的,品牌显卡做工不差,GTS450玩一般的主流3D游戏能够流畅,包括有主流3D网游,机箱和电源都是一线的品牌,超频三(PCCOOLER)X5炫彩版 额定350W 120mm风扇,足够带得动这套配置。


3000元怎么组装台式电脑?

今天我大学同学也让我给他配个3000的电脑,林哥哥我没有考虑独立显卡,因为这个主板自带的集显性能很强了。如果你硬要个显卡,那你把我推荐的主板换个400块左右的就行,然后买个SAPPHIRE 蓝宝石 Radeon HD4830 575MHz 1800MHz 512MB 256-bit GDDR3 显卡 价格是649.性能绝对强大。以下都是今天2010年4月13日19:53:25 我在新蛋网上结合最新的报价提供给楼主的,不信你自己去看。

配件名称 型号 价格
CPU AMD Athlon II X2 240 415
散热器 CPU自带
主板 MSI 微星 785GTM-E45 528
内存 Kingston 金士顿 DDR2 800 2GB 台式机内存 318
硬盘 Hitachi 日立 500GB 串口 7200 RPM 16MB SATA 3.0Gb/s 379
显卡 主板集成HD4200
声卡 主板集成
网卡 主板集成
光驱 台电 22X SATA DVD 刻录机 TL-22XDVDRW-SK 165
机箱 Foxconn 富士康 超狐系列 TSAA-089 机箱 黑色 99
电源 Huntkey 航嘉 冷静王钻石版 300W 电源 195
鼠标、键盘 A4Tech 双飞燕 KR-8562 USB 黑色 键鼠套装 88
显示器 优派 VA2013w 20英寸 宽屏 液晶显示器 867
合计 3054

这个配置里,
1, CPU除了推荐的这个,还可以考虑AMD Athlon II X3 425 2.7GHz AM3 3x 512K 45nm 盒装CPU 价格是519,但是它是三核的。我不推荐买intel的CPU,性价比不如AMD.
2, 主板方面是一个小型的主板,上面集成了目前最强的集成显卡,玩游戏是绰绰有余,图形能力比300块的独立显卡还要强,你玩个一般的游戏和看个高清的电影,比如720P格式的,是完全没有问题。
3, 机箱本来是给你推荐的CoolerMaster 酷冷至尊 破坏者 黑色 机箱 价格是218.因为我自己是用的这个机箱,我觉得做工和用料不错,钢板厚实而且机箱还带有散热风扇。但是价格是218,所以我又推荐了个99的给你。
4, 搭了一个刻录机,如果你不刻录,可以光买个光驱就行了,不超过120.不过我觉得现在光驱和刻录机的差价只有几十块,不如买个刻录机,可以把自己喜欢的东西刻录上。
5, 显示器,除了这个,还可以买优派的 VA1940,我觉得这个显示器也不错,是19寸的,价格大概是888.
6, 去电脑城配电脑,不要信老板推荐的,你就安装这个配置单来,老板没货是可以去其他店家调货的。他推荐给你的,一般都是垃圾产品。如果他硬是要推荐,那我们就走人。这个配置里,极个别产品可能会缺货,如果你问了好几家,都是某个产品没有的话,那就换个配置,但一般情况下不要更改,不要被老板忽悠。主板最还是集成最新的显卡的。
7, 祝楼主买机器愉快,花了我一个半小时在新蛋网上找配置
8, 网速快不快和你的网络有关,跟电脑关系不大


360杀毒说我的电脑安装了金山毒霸,但是我在电脑中找不到怎么回事?

您好这可能是您的电脑之前安装过没有彻底清除保留了键值,或者检测错误您可以到腾讯电脑管家官网下载一个电脑管家使用电脑管家——软件管理——软件卸载功能,找一下看是否有这个软件如果没有的话就使用电脑【清理垃圾】全选所有垃圾类型,一键清理就可以了。如果还有其他疑问和问题,欢迎再次来电脑管家企业平台进行提问,我们将尽全力为您解答疑难

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