学校位于南京市模范马路94号，学校占地面积1万多平方米，建筑面积5000平方米。学校有教学班37个，在校学生1600余人，在编教师87人。南京市三牌楼小学是江苏省省级实验小学，位于新模范马路94号。其前身为创建于1912年的“江宁市立第二十四初级小学”，1927年6月改名为三牌楼小学。
学校重视实施素质教育，学生兴趣、爱好和特长培养，尊重学生个性，增进学生心理健康，促进学生“生动、活泼、主动”发展；学校注重用教育理论指导学校实施科学管理，遵循教育规律，树立新的教育理念，深入进行课程改革实验和开展教育科学研究，促进了学校教育教学质量提高，学校心理教育、科普教育已形成办学特色，是一所受到社会公认，家长欢迎的江苏省实验小学。
悠久的历史，使学校积累了丰厚的办学经验和精神财富。1991年校园完成了全面改造后，学校坚持“管理高水平、设施高标准、教师高素质、学生高质量”的办学目标，经过十多年的艰苦努力，学校已成为一所环境优美、设施齐全、管理规范、质量稳定、校风优良、特色鲜明的先进学校，1998年被命名为“南京市示范学校”、“南京市心理教育实验学校”，2000年10月通过“南京市实验小学”的评审，2001年通过“江苏省实验小学”的评审。
近几年来，学校致力于走科研兴校、内涵发展之路，现有省级、市级立项课题各两个，探索教育、孝道教育、心理教育等已形成三小办学品牌。
学校占地1万多平方米；有39个教学班，学生一千九百多人；一线在职教师81人，大专学历占42%；本科学历占42%，研究生学历占2.4%。小学高级教师55人，中学高级教师3人，市、区优青及学科带头人22人，四百多篇论文在全国、省、市、区获奖或发表，有一支凝聚力强、业务素质高、勤奋进取的科研型教师队伍。
学校核心理念：坚韧探索
学校发展愿景：创造·典范传中华美德，做高品位实小。
学校培养目标：小小探索者，大大思想家
管理理念：宽松、和谐、进取
校训：诚朴尊重
校风：崇孝博学自主探索
学风：勤学乐学会学博学
南京市三牌楼小学是“江苏省实验小学”。三牌楼小学是一所环境优美、设施齐全、管理规范、质量稳定、校风优良、特色鲜明的省、市级重点小学。1998年被评为“南京市示范学校”，2000年被评为“南京市实验小学”，2002年被确认为“江苏省实验小学”，学校还是南京市优秀景观学校，校园被评为“南京市优美校园”。
学校一线在职教师8人中，学历全部达标。多年来学校坚持全面贯彻党的教职工教育方针政策，大力推进素质教育，坚持面向全体学生，以“全面发展有个性，活泼健康有特长，诚信守法有志向”为育人目标，确立了学校“管理高水平、设施高标准、教育高质量、办学品味”为育人目标。我校30%以上是省、市、区教学骨干，其中市优秀青年教师4人，区优秀青年教师8人，区学科带头人4人。
学校积极开展教育科研活动，“十五”省级主课题“在小学开展探索性教育活动的认识与实践”已通过审核，成为省级正式立项课题，已经结题。省级十一五课题《培养小学生形成良好孝德的实践与研究》也即将结题。学校多年来在低年级开展双语教学实验活动，在三、四年级开设计算机信息课，取得了较好的成绩。
学校加大对现代化教育装备的投资力度。2000年，现代化教育装备投资占事业发展经费的12%左右，2001年，占事业发展经费的14%左右，学校先后建成了语音室，第一电脑教室，第二电脑教室，舞蹈房，自然实验室等现代教育装备。保证每一个学生都能接受高水平、高质量的素质教育。
上放学时间一至六年级皆为7:40开始早读。8:00开始上课，早读期间到校不算迟到。
一至五年级3:10~20放学。学校设有前后门，前门是老师放学，后门为家长志愿者送孩子放学。
普通班六年级学生4:30放学；A、B班同学在虹桥的教师进修学校上课，5:00放学。
家长护学岗三牌楼小学设有家长护学岗，每天早晨由班级顺序（每学期的护送顺序为一（1）班 → 一（2）班以此类推）来派出家长志愿者。一切前提为自愿。
家长志愿者会与老师一起在学校正门口和左右两旁护送孩子上学。
钱学森班三牌楼小学是第一所设有钱学森班的小学。
2014年10月正式开班，一至六年级都有此课程，每个年级课程都不同。
分别是“金童话创作”，“小问号科学”、 “1+1数学”、“金苹果创新”、“小飞罗哲学”、“E时空创意”。
