开展多尺度细胞系统生物学，关键网络系统生物学建模和分析。
开展基于网络药理学、生物信息学和化学信息学的中药活性成分预测、组方优化和传统药方二次开发。
开展基于比较基因组学的作物病虫、菌关键靶点发现，寻找植物源先导结构、开发农药新品种。
主讲课程先后承担本科生生物信息学、过程模拟和优化等课程教学，为博、硕士研究生讲授计算生物学进展、计算系统生物学、药物学等课程。目前已培养硕士研究生15名；在读硕士研究生12名，博士研究生5名。
主要贡献主持项目1.细胞内随机时－空模拟理论、计算方法及在计算系统生物学中的应用，国家自然科学基金，2009-2011。编号：10801025。
2.肿瘤发生的数学模拟研究。国家自然科学基金，编号：10911130216/A011403。
3.中药治疗自身免疫性疾病复方作用原理计算机预测与验证研究, 中国中医科学院专项基金，2011-2012。
4.甲型H1N1流感、手足口病中药筛选和适宜技术产品的研发。中医药行业科研专项子课题，2011-2012。
5.细胞分子网络混合尺度动力学理论及其在系统生物学上的应用。国家自然科学基金，2012-2016，编号：31170796。
6.醒脑静脑部疾病的网络药理学研究，企业横向课题，2012-2013。
7.基于生物信息学技术的克服P450介导的昆虫抗药性新型农药优化和开发。农药国家重点实验室开放课题。2012-2013。
8.西北农林科技大学科研启动基金，2011-2013。
9.P450介导的昆虫抗药性机制研究，西北农林科技大学优秀青年人才科研专项，2011-2015。
代表性成果目前已申报农药国家发明专利6项(新化合物)。先后在《PLOS Computational Biology》, 《PLoS ONE》, 《Journal of Chemical Information and Modeling》《Current Medicinal Chemistry》和《Journal of Computer-Aided Molecular Design》等刊物上发表SCI 论文50余篇；近两年代表性论文如下（10篇）：
1.X Xu, X Wang, Zh Xiao, Y Li,
YH Wang*
. Probing the structural and functional link between mutation- and pH-dependent hydration dynamics and amyloidosis of transthyretin. Soft Matter. 2011,DOI:
10.1039/C1SM06569F, (IF:4.5)2.X Wang, X Xu, Z Ma, YQ Huo, Zh Xiao, Y Li,
YH Wang*
. Dynamic mechanisms for pre-miRNA binding and export by Exportin-5, RNA, 2011, RNA 2011. 17: 1511-1528. (IF：6.1)3.W Zhou, Y Li, X Wang, L Wu,
YH Wang*
. MiR-206-mediated dynamic mechanism of the mammalian circadian clock. BMC Syst Biol, 2011, 5:141. (IF:3.6)4.Z Xiao, X Wang, X Xu, H Zhang, Y Li
YH Wang*
. Base- and Structure-Dependent DNA Dinucleotide-Carbon Nanotube Interactions: Molecular Dynamics Simulations and Thermodynamic Analysis. 2011,DOI: 10.1021/jp204017u. (IF:4.4)[Cover Paper]
5.Q Li, L Zhang, Z Ma, X Kong, F Wang, H Zhang
YH Wang*
. Probing Structural Features and Binding Mode of 3-Arylpyrimidin-2,4-diones within Housefly γ-Aminobutyric Acid (GABA) Receptor. Int J Mole Sci, 2011, 12, 1-x; doi:10.3390/ijms120x000x .(IF:2.3)6.X Wang, X Xu, S Zhu, Zh Xiao, Z Ma, Y Li
YH Wang*
. Molecular dynamics simulation of conformational heterogeneity in Transportin 1. Proteins. 2011, DOI: 10.1002/prot.23193. (IF:2.8)7.X Xu, H Wang, J Fu,
YH Wang*
. Influence of P-glycoprotein on Embryotoxicity of Antifouling Biocides to Sea Urchin (Strongylocentrotus intermedius). Ecotoxicology, 2011 Mar;20(2):419-28. (IF: 3.1)8.X Xu, X Wang, Z Xiao, Y Li,
YH* Wang
.Two TPX2-Dependent Switches Control the Activity of Aurora A. PLoS ONE 6(2): e16757. doi:10.1371/journal.pone.0016757.2011. (IF: 4.3)9.
YH Wang*
, Y Li, Zhi Ma, W Yang. Mechanism of MicroRNA-Target Interaction: Molecular Dynamics Simulations and Thermodynamics Analysis, PLOS Comput Bio, 2010, 2010,6(7)，e1000866. (IF：5.8)10.G Wang, Y Li ,X Liu,
YH Wang*
. Understanding the Aquatic Toxicity of Pesticide:Structure-Activity Relationship and Molecular Descriptors to Distinguish the Ratings of Toxicity. 2009, QSAR & comb Sci.28:11-12, 1418–1431.
(IF:3.0)所获荣誉第九届陕西青年科技奖
2012年陕西省科学技术进步奖二等奖，第一名
2012年度杨凌示范区科学技术奖一等奖，第一名
2006年辽宁省自然科学学术成果二等奖，第一名[1]
